Лабораторія біосинтезу білка

Завідувач лабораторії доктор біологічних наук, професор Негруцький Борис Сергійович Тел: (380-44) 526-43-97; факс: (380-44) 526-07-59; E-mail: negrutskii@imbg.org.ua

Науковий напрямок:

Визначення факторів і молекулярних механізмів, що зумовлюють ефективність і точність завершальних стадій експресії геному у вищих еукаріотів

Сучасні наукові дослідження:

• Вивчаються механізми компартменталізації апарату білкового синтезу вищих еукаріотів, зокрема каналювання тРНК під час трансляції. Розроблено концепцію спрямованого транспорту тРНК та аміноацил-тРНК під час трансляції в клітинах ссавців. Встановлено, що каналювання тРНК відбувається за рахунок формування неканонічних комплексів eEF1A з деацильованою тРНК та аміноацил-тРНК синтетазами.
• Досліджується роль фактора елонгації трансляції 1А (eEF1A) в біосинтезі білка, а також відмінності в функціях двох ізоформ цього білка при канцерогенезі та інших клітинних процесах. Показано, що ці ідентичні на 93% ізоформи мають відмінності на рівні просторової структурної організації та по-різному взаємодіють із деякими клітинними білками. Вивчаються особливості експресії різних субодиниць мультибілкового комплексу eEF1 людини в пухлинах різної локалізації.
• Отримано докази того, що eEF1A належить до сім’ї білків із частково невпорядкованою структурою. Встановлено, що eEF1A та рибосоми мають шапероноподібні властивості, що є важливим для підтримання активної конформації білкових компонентів апарата трансляції.
• На модельних системах досліджуються молекулярні процеси, які зумовлюють перехід до проліферації клітин, які не діляться. Вивчаються механізми регуляції активності детоксикаційної системи в плаценті людини з врахуванням генетичних особливостей індивідуума та дії шкідливих чинників довкілля
• Запропоновано часову шкалу регенераційного процесу на основі проліферативної активності та синтезу цитокінів паренхімними та непаренхімними клітинами печінки. Вперше продемонстровано участь інтерферону альфа в переході клітин регенеруючої печінки від “спокою” в проліферативному відношенні до активної проліферації. Доведено, що ефективність детоксикації в плаценті людини залежить від навантаження організму матері з боку шкідливих чинників довкілля та від типу поліморфізма в генах детоксикації плаценти.

Вибрані публікації:

1. Lukash T.O., Turkivska H.V., Negrutskii B.S., El’skaya F.V. (2004) Chaperone-like activity of mammalian elongation factor eEF1A: renaturation of aminoacyl-tRNA synthetases. Int J Biochem Cell Biol. 36(7):1341-1347.
2. Budkevich, T.V., Timchenko, A. A., Tiktopulo, E.I., Negrutskii, B.S., Shalak, V.F., Petrushenko, Z.M., Aksenov, V.L., Willumeit, R., Kohlbrecher, J., Serdyuk, I.N., El’skaya, A.V. (2002) Extended conformation of mammalian translation elongation factor 1A in solution Biochemistry 41, 15342-15349.
3. Petrushenko Z.M., Budkevich T.V., Shalak V.F., Negrutskii B.S., El’skaya A.V. (2002) Novel complexes of mammalian translation elongation factor eEF1A*GDP with uncharged tRNA and aminoacyl-tRNA synthetase. Implications for tRNA channeling. Eur. J. Biochem. 269, 4811-4818.
4. Negrutskii B.S., Shalak V.F., Kerjan P., El’skaya A.V., Mirande M. (1999) Functional interaction of mammalian valyl-tRNA synthetase with elongation factor EF-1A in the complex with EF-1H. J.Biol. Chem. 274, 4545-4550.
5. Negrutskii B.S., El’skaya A.V. (1998) Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha: structure, expression, functions, and possible role in aminoacyl-tRNA channeling. Progr.Nucl.Acids Res.Mol.Biol. 60, 47 – 78.
6. Petrushenko Z.M., Negrutskii B.S., Ladokhin A.S., Budkevich T.V., Shalak V.F., El’skaya A.V. (1997) Evidence for the formation of an unusual ternary complex of rabbit liver EF-1а with GDP and deacylated tRNA. FEBS Lett. 407, 13-17.
7. Negrutskii B. S., Budkevich T. V., Shalak V. F., Turkovskaya G. V., El’skaya A. V. (1996) Rabbit translation elongation factor 1 alpha stimulates the activity of homologous aminoacyl-tRNA synthetase. FEBS Lett. 382, 18-20.
8. Obolenskaya M.Yu., Schulze-Specking A., Plaumann B., Frenzer K., Freudenberg N. and K. Decker. (1994) Nitric oxide production by cells isolated from regenerating rat liver. Biochem.Biophys. Res. Comm. - V. 204, № 3. - Р. 1305 –1311.
9. Obolenskaya M.Yu. (1997) Cytokines and liver regeneration. - EOS - J. Immunology and Immunopharmacology. - V.17, № 2. - Р. 51 -58.
10. Obolenskaya M.Yu., Samoylenko A.A. (2000) Does nitric oxide regulate the transduction of TNF signal?- EOS - J. Immunology and Immunopharmacology. - V.20, № 1. - Р. 13-20.
11. Budkevich TV, El'skaya AV, Nierhaus KH. Features of 80S mammalian ribosome and its subunits. Nucleic Acids Res. 2008;36(14):4736-44.
12. Panasyuk G., Nemazanyy I., Filonenko V., Negrutskii B., El'skaya A. A2 isoform of mammalian translation factor eEF1A displays increased tyrosine phosphorylation and ability to interact with different signalling molecules Int J Biochem Cell Biol. 2008;40(1):63-71.
13. Kanibolotsky DS, Novosyl'na OV, Abbott CM, Negrutskii BS, El'skaya AV. Multiple molecular dynamics simulation of the isoforms of human translation elongation factor 1A reveals reversible fluctuations between "open" and "closed" conformations and suggests specific for eEF1A1 affinity for Ca2+-calmodulin. BMC Struct Biol. 2008;8:4.